UK Variant Landscape

Data updated 22-11-2024 at 07:22 using the latest COG-UK data with variants assigned using Nextclade.
Two week change is calculated as the percentage change in the percentage of the variant in the last two weeks compared to the previous two weeks.

Variant	Level	29/09 - 05/10 (535 seq.)		06/10 - 12/10 (490 seq.)		13/10 - 19/10 (463 seq.)		20/10 - 26/10 (406 seq.)		27/10 - 02/11 (321 seq.)		2 week Change
		#	%	#	%	#	%	#	%	#	%
KP.3.1.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1)		231	43.18	212	43.27	171	36.93	170	41.87	122	38.01	-0
XEC (XEC)		109	20.37	90	18.37	126	27.21	100	24.63	94	29.28	18
MC.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.1)		16	2.99	14	2.86	16	3.46	13	3.2	10	3.12	0
MC.13 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.13)		21	3.93	20	4.08	22	4.75	11	2.71	1	0.31	-63
XEC.2 (XEC.2)		15	2.8	28	5.71	14	3.02	21	5.17	13	4.05	6
MC.16 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.16)		6	1.12	8	1.63	9	1.94	4	0.99	5	1.56	-31
KP.3.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1)		3	0.56	3	0.61	1	0.22	5	1.23	5	1.56	228
MC.11 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.11)		6	1.12	8	1.63	5	1.08	10	2.46	2	0.62	21
MC.6 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.6)		4	0.75	2	0.41	4	0.86	2	0.49	4	1.25	31
MC.9 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.9)		6	1.12	9	1.84	5	1.08	2	0.49	2	0.62	-63
KP.2.3 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3)		6	1.12	4	0.82		0	2	0.49		0	-34
MC.10 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.10)		4	0.75		0	5	1.08	4	0.99	4	1.25	110
KP.3.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3)		3	0.56		0	1	0.22	1	0.25	1	0.31	162
XEK (XEK)		1	0.19	5	1.02	7	1.51	4	0.99	5	1.56	-2
KP.3.3.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.2)		5	0.93		0	5	1.08	3	0.74	5	1.56	110
MC.8.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.8.1)		5	0.93	4	0.82	1	0.22	3	0.74	4	1.25	84
LB.1.3.1 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1)		3	0.56	3	0.61	1	0.22	1	0.25	1	0.31	-34
MC.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.2)		2	0.37	4	0.82	2	0.43	1	0.25	2	0.62	-34
MC.19 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.19)		6	1.12	4	0.82		0		0	1	0.31	-67
MC.1.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.1.1)		1	0.19	5	1.02	7	1.51	3	0.74	1	0.31	-56
KP.1.1.3 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3)		2	0.37	1	0.2		0	1	0.25	1	0.31	162
KP.3.2.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.3)		1	0.19		0		0		0		0	0
KP.3.3.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.1)		4	0.75	5	1.02		0	1	0.25		0	-74
KP.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3)			0		0		0	1	0.25	1	0.31	0
MV.1 (BA.2.86.1.1.49.1.1.1.1.1)		3	0.56	3	0.61	1	0.22	2	0.49		0	-34
XDY (XDY)		3	0.56	2	0.41	3	0.65	3	0.74	1	0.31	5
LB.1 (BA.2.86.1.1.9.2.1)		1	0.19		0	1	0.22	1	0.25		0	31
MC.10.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.10.1)			0	4	0.82	5	1.08	3	0.74	4	1.25	2
LF.7.1 (BA.2.86.1.1.16.1.7.1)		3	0.56	4	0.82	2	0.43	3	0.74		0	-34
MC.2.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.2.1)		3	0.56		0		0	1	0.25		0	0
LB.1.3 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3)		2	0.37	3	0.61	2	0.43		0	1	0.31	-74
KP.3.3.4 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.4)			0		0		0		0		0	0
KP.2.2 (BA.2.86.1.1.11.1.2.2)		1	0.19		0	2	0.43		0		0	0
NF.1 (BA.2.86.1.1.16.5.1)		4	0.75	1	0.2		0		0	1	0.31	31
LF.9.1 (BA.2.86.1.1.16.1.9.1)		4	0.75	2	0.41		0		0		0	0
LW.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.3.1)		1	0.19	1	0.2		0	2	0.49		0	162
KP.1.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1)		1	0.19		0		0		0		0	0
MC.22 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.22)		1	0.19	4	0.82		0		0	1	0.31	-67
NL.6 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1.6)		3	0.56	2	0.41	1	0.22		0		0	0
LF.7 (BA.2.86.1.1.16.1.7)		2	0.37		0	2	0.43	1	0.25	2	0.62	97
KP.2.25.2 (BA.2.86.1.1.11.1.2.25.2)			0		0		0		0		0	0
MC.15 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.15)		3	0.56		0		0		0		0	0
MU.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.5.1)		3	0.56		0	2	0.43	1	0.25	2	0.62	97
ND.1.1 (BA.2.86.1.1.16.1.8.1.1.1.1)		3	0.56	1	0.2		0		0	2	0.62	162
NL.3 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1.3)		1	0.19		0		0	2	0.49	3	0.93	0
XEL (XEL)			0		0	2	0.43	2	0.49		0	31
MC.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.3)			0		0	2	0.43	1	0.25	2	0.62	97
KP.3.1.8 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.8)		1	0.19	2	0.41	1	0.22	1	0.25	1	0.31	-13
KP.3.2.4 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.4)			0		0		0		0		0	0
MK.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.6.1)			0	2	0.41		0	1	0.25		0	-34
KP.3.7 (BA.2.86.1.1.11.1.3.7)		3	0.56		0	1	0.22		0		0	0
XEC.4 (XEC.4)		1	0.19	3	0.61	3	0.65		0	1	0.31	-78
KP.3.1.4 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.4)			0		0		0	1	0.25		0	0
LB.1.2.1 (BA.2.86.1.1.9.2.1.2.1)		2	0.37	2	0.41		0		0		0	0
XEC.5 (XEC.5)			0	2	0.41	4	0.86	1	0.25	1	0.31	-56
KP.3.1.5 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.5)		3	0.56	2	0.41		0		0		0	0
MC.8 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.8)		2	0.37		0	2	0.43		0		0	0
KP.3.2.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.1)			0		0		0		0		0	0
MC.13.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.13.1)		2	0.37		0		0		0	1	0.31	0
KP.2.3.11 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.11)			0		0		0	1	0.25		0	0
KP.2.3.5 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.5)			0		0		0		0		0	0
KP.3.2.5 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.5)		1	0.19		0		0		0		0	0
LB.1.2 (BA.2.86.1.1.9.2.1.2)			0		0		0		0		0	0
LB.1.2.3 (BA.2.86.1.1.9.2.1.2.3)			0		0	1	0.22		0	3	0.93	293
LF.7.3 (BA.2.86.1.1.16.1.7.3)			0	2	0.41	2	0.43	1	0.25	1	0.31	-34
LF.7.4 (BA.2.86.1.1.16.1.7.4)		1	0.19	3	0.61		0		0	1	0.31	-56
XEC.6 (XEC.6)			0	2	0.41		0	1	0.25		0	-34
LP.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.1)		2	0.37	1	0.2		0	1	0.25	2	0.62	293
KP.2.14 (BA.2.86.1.1.11.1.2.14)			0		0		0		0		0	0
KP.4.2.4 (BA.2.86.1.1.11.1.4.2.4)			0	2	0.41	1	0.22		0		0	0
KS.1.1 (BA.2.86.1.1.13.1.1.1)			0		0		0		0		0	0
NL.5 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1.5)			0		0	2	0.43		0		0	0
LB.1.7 (BA.2.86.1.1.9.2.1.7)			0		0		0		0	1	0.31	0
LF.7.2.1 (BA.2.86.1.1.16.1.7.2.1)			0		0	1	0.22		0		0	0
JN.1.16 (BA.2.86.1.1.16)		1	0.19		0	1	0.22		0		0	0
MC.14 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.14)			0	1	0.2		0		0		0	0
MC.4 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.4)		1	0.19		0	1	0.22	1	0.25		0	31
MR.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.4.1)			0		0	1	0.22		0		0	0
NC.1.2 (BA.2.86.1.1.13.1.1.1.1.1.2)			0		0	1	0.22	2	0.49	1	0.31	293
KS.1.1.2 (BA.2.86.1.1.13.1.1.1.2)			0		0		0		0		0	0
XDV.1 (XDV.1)			0		0		0		0		0	0
LB.1.4 (BA.2.86.1.1.9.2.1.4)		1	0.19		0		0		0		0	0
XEC.1 (XEC.1)			0	1	0.2		0		0		0	0
LF.7.1.3 (BA.2.86.1.1.16.1.7.1.3)			0		0	3	0.65		0	1	0.31	-56
XEF (XEF)			0		0		0		0		0	0
LY.1 (BA.2.86.1.1.18.6.1)			0		0		0		0		0	0
MC.11.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.11.1)			0		0		0	1	0.25		0	0
MC.17 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.17)			0		0		0	2	0.49		0	0
KP.3.2.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.2)			0		0		0		0		0	0
LP.7 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.7)			0		0		0		0		0	0
KP.1.1.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.1)			0	1	0.2		0	1	0.25		0	31
KP.2 (BA.2.86.1.1.11.1.2)			0		0		0		0		0	0
KP.2.3.4 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.4)			0		0		0		0		0	0
KP.2.3.8 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.8)			0		0		0		0		0	0
KP.2.6 (BA.2.86.1.1.11.1.2.6)			0		0		0		0		0	0
MC.21 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.21)		1	0.19	1	0.2		0		0		0	0
KP.3.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2)			0		0		0		0		0	0
KP.3.6 (BA.2.86.1.1.11.1.3.6)		2	0.37		0		0		0		0	0
NA.1 (BA.2.86.1.1.49.1.1.1.2.1)			0		0		0	1	0.25	1	0.31	0
NH.4 (BA.2.86.1.1.11.1.2.2.1.4)			0		0		0		0		0	0
NK.1 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.10.1)			0	1	0.2		0	1	0.25		0	31
NL.2 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1.2)			0		0	1	0.22		0		0	0
LB.1.3.2 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.2)			0		0	2	0.43		0		0	0
LF.8.1.1 (BA.2.86.1.1.16.1.8.1.1)		1	0.19	1	0.2		0		0		0	0
XED (XED)			0		0		0		0		0	0
JN.1.16.3 (BA.2.86.1.1.16.3)			0	1	0.2		0		0		0	0
JN.1.16.5 (BA.2.86.1.1.16.5)			0		0	1	0.22		0		0	0
JN.1.50 (BA.2.86.1.1.50)			0		0		0		0	1	0.31	0
XEP (XEP)		1	0.19		0	1	0.22		0		0	0
LP.8.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.8.1)			0		0	1	0.22	1	0.25		0	31
KP.1.1.5 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.5)			0		0		0		0		0	0
MA.1 (BA.2.86.1.1.18.3.1)			0		0		0		0		0	0
MA.1.1 (BA.2.86.1.1.18.3.1.1)		2	0.37		0		0		0		0	0
KP.2.19 (BA.2.86.1.1.11.1.2.19)			0		0		0		0		0	0
KP.2.2.1 (BA.2.86.1.1.11.1.2.2.1)			0		0		0		0	1	0.31	0
MC.21.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.21.1)		1	0.19		0		0		0		0	0
MG.3 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.1.3)		1	0.19		0		0		0		0	0
KP.3.2.8 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.8)			0		0	1	0.22		0		0	0
KP.3.3.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.3)			0		0		0		0		0	0
KS.1 (BA.2.86.1.1.13.1.1)			0		0	1	0.22		0		0	0
LB.1.2.2 (BA.2.86.1.1.9.2.1.2.2)			0		0		0		0		0	0
NL.4 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.1.4)			0		0	1	0.22		0		0	0
LB.1.3.3 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.3)			0		0		0		0		0	0
XDV.1.3 (XDV.1.3)			0		0		0		0		0	0
LB.1.5 (BA.2.86.1.1.9.2.1.5)			0		0		0		0		0	0
XDY.1 (XDY.1)			0	1	0.2		0		0		0	0
LB.1.7.1 (BA.2.86.1.1.9.2.1.7.1)			0	1	0.2		0		0		0	0
LF.1 (BA.2.86.1.1.16.1.1)			0		0		0		0		0	0
LF.4.1 (BA.2.86.1.1.16.1.4.1)			0		0		0		0		0	0
LF.7.1.1 (BA.2.86.1.1.16.1.7.1.1)			0		0		0		0		0	0
LF.7.1.2 (BA.2.86.1.1.16.1.7.1.2)			0		0		0		0		0	0
EG.5.1.1 (XBB.1.9.2.5.1.1)			0		0		0		0		0	0
LF.7.2 (BA.2.86.1.1.16.1.7.2)			0		0		0		0		0	0
FL.3.3 (XBB.1.9.1.3.3)		1	0.19		0		0		0		0	0
GJ.1.2 (XBB.2.3.3.1.2)			0		0		0		0		0	0
XEC.3 (XEC.3)			0		0	1	0.22		0		0	0
JG.3 (XBB.1.9.2.5.1.3.3)			0		0		0		0		0	0
JN.1 (BA.2.86.1.1)			0		0		0		0		0	0
JN.1.16.1 (BA.2.86.1.1.16.1)			0		0		0		0		0	0
LP.1.2 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.1.2)			0		0		0		0		0	0
LP.10.1 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.10.1)			0		0		0		0		0	0
JN.1.18.2 (BA.2.86.1.1.18.2)			0		0		0		0		0	0
LP.2 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.2)			0		0		0		0		0	0
JN.1.18.6 (BA.2.86.1.1.18.6)		1	0.19		0		0		0		0	0
XEN (XEN)			0		0		0	1	0.25		0	0
LP.6 (BA.2.86.1.1.11.1.1.1.3.6)			0		0		0		0		0	0
JN.1.50.2 (BA.2.86.1.1.50.2)			0		0		0		0		0	0
JN.1.9.2 (BA.2.86.1.1.9.2)			0		0		0		0		0	0
LW.1.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.3.1.2)			0		0		0		0		0	0
LZ.1 (BA.2.86.1.1.18.2.1)			0		0	1	0.22		0		0	0
LZ.1.1 (BA.2.86.1.1.18.2.1.1)			0		0		0		0		0	0
LZ.2 (BA.2.86.1.1.18.2.2)			0		0		0		0		0	0
KP.2.15.1 (BA.2.86.1.1.11.1.2.15.1)			0		0		0		0		0	0
KP.2.16 (BA.2.86.1.1.11.1.2.16)			0		0		0		0	1	0.31	0
KP.2.23 (BA.2.86.1.1.11.1.2.23)			0		0		0		0		0	0
KP.2.24 (BA.2.86.1.1.11.1.2.24)			0		0		0		0		0	0
MC.13.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.13.2)		1	0.19		0		0		0		0	0
KP.2.3.12 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.12)			0		0		0		0		0	0
KP.2.5 (BA.2.86.1.1.11.1.2.5)			0		0		0		0		0	0
KP.3.1.3 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.3)			0		0		0	1	0.25		0	0
KP.3.1.6 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.6)			0		0		0		0		0	0
MC.5 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.1.5)			0		0		0		0		0	0
KP.3.1.7 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.7)			0		0		0	1	0.25		0	0
MH.1 (BA.2.86.1.1.9.2.1.3.2.1)			0		0		0		0		0	0
ML.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.3.3.2)			0		0		0		0		0	0
MM.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.4.1)			0		0		0		0		0	0
KP.3.2.9 (BA.2.86.1.1.11.1.3.2.9)			0	1	0.2		0		0		0	0
MM.2 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.4.2)			0		0		0		0		0	0
MQ.1 (BA.2.86.1.1.7.8.1)			0		0		0		0		0	0
MT.1 (BA.2.86.1.1.16.4.1)			0		0		0		0		0	0
KP.3.5 (BA.2.86.1.1.11.1.3.5)			0		0		0		0		0	0
MW.1 (BA.2.86.1.1.11.1.2.3.7.1)			0		0		0		0		0	0
MY.1 (BA.2.86.1.1.11.1.3.1.8.1)			0		0		0		0		0	0
KP.4.1 (BA.2.86.1.1.11.1.4.1)			0		0		0		0		0	0
NA.1.1 (BA.2.86.1.1.49.1.1.1.2.1.1)			0	1	0.2		0		0		0	0
NB.1 (XDV.1.5.1.1)			0		0		0		0		0	0
NC.1.1 (BA.2.86.1.1.13.1.1.1.1.1.1)			0		0		0		0		0	0